Xoay quanh học sinh nam tên Itsuka Shidou, người đã gặp một cô gái tinh linh đến từ một thế giới đã bị phá hủy, người đã gây nên nhiều cơn chấn động thời không.Và chàng trai phải ngăn chặn cô gái bằng cách hẹn hò với cô ta.
Mười năm sau khi IS đầu tiên được công bố,thế giới đã tiến vào 1 kỷ nguyên hòa bình. Tuy nhiên,hòa bình đó sớm tan vỡ bởi một phát hiện không thể ngờ. Một thiếu niên người Nhật 15 tuổi,tên là Ichika Orimura, được phát hiện rằng có khả năng điều khiển 1 IS. Nhận ra tiềm năng của cậu, bị chính phủ Nhật ép buộc,Ichika phải nhập học Học Viện Infinite Stratos uy tín, một trường học quốc tế nơi các phi công IS từ khắp thế giới vào học. Và cuộc sống là 1 học sinh bận rộn của cậu bị bao quanh bởi các
Itose Yuki là một sinh viên đại học bị khiếm thính. Thế giới của cô đã bị bao phủ bởi sự im lặng kể từ khi sinh ra. Cô rất hiếm khi giao tiếp với người ngoài, ngoại trừ người bạn thân của mình là Fujishiro Rin
Bầu trời rộng lớn kết nối tới mọi thứ... Tới con người... tới biển cả... tới những thành phố... và cả đêm tối nữa... Bên kia bầu trời chính là màn đêm. Nơi đó cũng có một bầu trời được kết nối với bầu trời đang hiện hữu trên chúng ta... Thế nên... mình đi dưới bầu trời... Cái bầu trời mà hai người họ đã tặng cho mình... Nè! Bầu trời! Ta thích mi lắm!
Nhật Bản thế kỷ 21 chỉ còn là một vùng sa mạc rộng lớn, nằm dưới sự trị vì của Vương triều Saffon bạo ngược. Lời tiên tri đã nói rằng một ngày kia, một đứa trẻ sẽ được sinh ra và khi trưởng thành, nó sẽ trở thành vị cứu tinh đem lại tự do cho đất nước. Khi hai đứa trẻ sinh đôi Tatara và Sarasa sinh ra tại làng Byakko, nhà tiên tri Nagi đã nói rằng Tatara chính là đứa con số mệnh mà lời tiên tri đã nhắc tới. Một ngày, quân đội của Xích Vương kéo tới làng Byakko, giết chết Tatara và cướp đi thanh