Tôn vinh y thuật chân chính, đề cao nhân cách trị bệnh cứu người. Thần y truyền kỳ là bộ phim kể về thời chiến quốc, một biến cố đã xảy ra khiến công chúa Triệu quốc Bán Hạ trở thành trẻ cô nhi. Cô lưu lạc nhân gian, tình cờ quen biết được với hai đệ tử của Thương Truật thần y là Cẩu Bảo và Độc Hoạt, cùng với con gái của ông là Đinh Hương.
Bối cảnh phim trải dài từ khi nhà Tùy thành lập, rồi diệt vong, cho đến khi Lý Thế Dân đăng cơ, tạo ra thời kỳ “Trinh Quan Chi Trị”, bên cạnh đó là những trận chiến của các anh hùng trại Ngõa Cương.
khi anh đến Giang Nam để điều tra vụ án. Giang Nam lúc đó bị bão lụt, nông dân nổi loạn và họ đi theo phái Tu La, giáo chủ ‘Tu La Bất Tử’ có ý đồ phục quốc nên tuyên chiến với triều đình. Anh lẻn vào cung điện ngầm và sau khi bắt sống giáo chủ thì giáo chủ lại bị bắn chết.
Trong lúc tìm kiếm phụ thân Hải Nhâm, thiếu nữ giao nhân Bao Nhục Nhục vướng vào vụ án giết người, tình cờ quen được thần thám vua ban Cố Tinh Hà.
Cuối đời Đường, Trường An liên tiếp xảy ra những vụ án mạng ly kỳ, họa sĩ nghèo có tài suy luận Độc Cô Trọng Bình, cô gái trốn nhà có trí nhớ phi thường Vi Nhược Chiêu cùng thanh niên nông nổi Lý Tú Nhất hợp thành nhóm thám tử lập dị chung tay tiêu diệt tội ác. Bên cạnh đó mối quan hệ giữa hai nam một nữ này cũng dần phát sinh..